Resumo: | Tendo em vista doenças infecto-parasitárias de grande incidência como a Leishmaniose, o estudo de alvos moleculares permite o planejamento de fármacos buscando ampliar o esquema terapêutico mundial. Com isso, a partir da modelagem molecular, foi realizada a construção, manipulação de modelos realistas de forma direta, por meio de estruturas tridimensionais do alvo biológico e da interação do mesmo com um ligante formando o complexo ligante-receptor. Para isso, o trabalho foi avaliado por simulações de docking molecular, que permitiu o acoplamento entre a enzima alvo CRK3 (cinase ciclina dependente), e os possíveis protótipos a fármacos derivados de éteres de oximas, resultando em possíveis orientações que possam prever melhor interação fármaco-receptor. Os protótipos em estudo, denominados como “ligantes TB”, derivados da vanilina, foram obtidos pela construção (desenho da estrutura), manipulação e preparo pela interface gráfica Maestro 9.3.5, utilizando o software LigPrep versão 2.5. Foram realizados otimização e preparo da enzima alvo, CRK3, homóloga da proteína CDK2 humana, construída e validada esteroquimicamente por estudos anteriores desenvolvidos pelo Laboratório de Modelagem Computacional – LaModel, instalado na UNIFAL-MG. Tal processo de otimização foi realizado por dois softwares, Protein Preparation Wizard e MacroModel 9.9, visando otimizar e melhorar a conformação proteica. Por fim, os estudos do docking molecular foram realizados por meio da suíte Schrödinger, utilizando-se o IFD (Induced Fit Docking) aplicado por meio do uso de dois outros programas do pacote Schrödinger: o Glide e o Prime, também utilizados junto à interface gráfica. Dessa forma, dentre oito moléculas estudadas as que apresentaram melhor resultado foram as moléculas denominadas TB 03 TRANS e TB 06 CIS, assim os resultados obtidos permitiram comprovar a efetividade do planejamento racional de fármacos baseando-se na modelagem molecular, e a possível interação entre a enzima CRK3 e os derivados de éteres de oximas, diminuindo etapas de uma posterior síntese química selecionando os melhores candidatos no combate à leishmaniose. |