IDENTIFICAÇÃO, CARACTERIZAÇÃO E CLASSIFICAÇÃO DOS GRUPOS FUNCIONAIS DAS PEQUENAS ORFS DE BRUCELLA ABORTUS.
Resumo:As bactérias do gênero Brucella são cocobacilos, Gram-negativas, que não esporulam, imóveis, aeróbicas ou microaeróbicas, causadoras de uma zoonose chamada brucelose. As bactérias desse gênero invadem o organismo hospedeiro pelas mucosas do trato digestório, mucosa genital, nasal ou conjuntiva ocular. Ao penetrar nas mucosas, estas bactérias são fagocitadas e carreadas até os linfonodos regionais, onde se multiplicam e podem permanecer por várias semanas ou meses. A brucelose é uma enfermidade de ampla distribuição, endêmica em várias regiões do Brasil sendo a brucelose bovina, causada pela espécie Brucella abortus, a mais difundida no mundo. Esta infecção afeta diretamente a economia do país, pelo fato da carne bovina ser um dos principais produtos de exportação pelo país. As pequenas proteínas são caracterizadas como aquelas codificadas por pequenas janelas abertas de leitura (smORFs) contendo de 1 a 99 códons. As smORFs são comumente associadas à codificação de pequenas proteínas incluindo uma série de moléculas com importantes funções celulares, como as proteínas envolvidas no metabolismo de energia, proteínas transportadoras, reguladores transcricionais e proteínas ribossômicas. As análises genômicas são de extrema importância para determinar o número de smORFs de uma bactéria. Sendo assim, o principal objetivo deste trabalho foi identificar, caracterizar e classificar funcionalmente as smORFs no genoma de Brucella melitensis biovar Abortus 2308 utilizando abordagens de bioinformática. Para acessar o genoma e as proteínas anotadas da Brucella, foi utilizando o Brucella Bioinformatics Portal (BBP). Nos cromossomos I e II foram anotados no NCBI 2012 e 1077 smORFs respectivamente. Utilizando o programa ORF Finder, foi obtido 4961 e 2881 smORFs nos cromossomos I e II, respectivamente, independente das análises das regiões regulatórias. Ao analisar o tamanho dos peptídeos codificados pelas smORFs, foi possível observar grandes diferenças na distribuição do tamanho destes peptídeos quando comparadas as análises das smORFs preditas daquelas anotadas. Ao analisar as putativas funções das smORFs utilizando o programa Gene Ontology, foi observado uma alta frequência de pequenas proteínas que codificam proteínas hipotéticas em ambos cromossomos. Os resultados deste trabalho indicam uma grande abundância de smORFs no genoma da Brucella melitensis biovar abortus 2308 que são capazes de expressar uma alta frequência de pequenas proteínas hipotéticas. Estudos adicionais devem ser feitos para avaliar e associar a expressão destas smORFs no processo de patogêneses da infecção pela Brucella e potenciais proteínas imunogênicas desta bactéria.
Referência 1:IC - AVALIAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO IN SILICO DE PEQUENAS ORFS DE BRUCELLA ABORTUS